Quais são as diferenças entre QEMU e VirtualBox?

Basicamente ambos têm características que o outro não tem, por isso isto pode facilitar a decisão. O QEMU / KVM é melhor integrado no Linux, tem uma pegada menor e deve, portanto, ser mais rápido.

VirtualBox é um software de virtualização limitado à arquitetura x86 e amd64. Xen usa o QEMU para a virtualização assistida por hardware, mas também pode paravirtualizar os hóspedes sem virtualização de hardware. O QEMU suporta uma vasta gama de hardware e pode fazer uso do KVM ao executar um arquitetura alvo que é o mesmo que a arquitetura host.

O Xen é um tipo-1 hipervisor onde o VirtualBox e o QEMU são considerados hipervisores do tipo-2 (também pode haver um debate considerando que o kvm é um módulo do kernel).

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